Você não precisa apontar o plugin Docs para a categoria - este plugin substitui o plugin Docs. Isso pode ser o que está afetando as coisas para você, pois causaria um conflito com um substituindo o outro.
Tudo o que você precisa fazer é garantir que doc categories enabled esteja marcado e, em seguida, criar o tópico do índice na categoria, adicionando-o às configurações da categoria no campo Tópico do Índice. Se você ainda tiver a categoria definida nas configurações antigas do plugin Docs, deverá removê-la de lá.