Você adivinhou certo. O filtro desapareceu devido a uma série de razões, que em essência foram falhas em repassar os dados corretos da categoria e rastrear as alterações adequadamente na interface do usuário.
Para mais detalhes sobre a correção aplicada, você pode verificar FIX: subcategory filter should be always visible on category view page by yuriyaran · Pull Request #36050 · discourse/discourse · GitHub.