Erros 404 (assets) na instalação em subpasta

Isso depende de qual software você está usando para fazer o proxy reverso.

Estou usando o Caddy e seguindo Use Caddy instead of NGINX as your reverse proxy

A única mudança em relação ao guia é adicionar a pasta no Caddyfile:

subfolder.muito.ninja

proxy /forum unix:/sock/nginx.http.sock {
  transparent
}