Converse com o provedor do VPS sobre aumentar a quantidade de RAM. Com RAM suficiente, você não precisa de swap.
Você pode considerar usar um utilitário de monitoramento de serviços, como o monit, para reiniciar automaticamente seu contêiner quando os processos falharem, mas o problema tende a piorar quanto mais usuários ativos você tiver, e há o risco de corromper o banco de dados ao longo do tempo.