Essa é uma adição muito legal, Kris! 
Como estamos prestes a introduzir uma nova página inicial por meio da saída custom-homepage, estou curioso para saber se essa nova configuração incluirá a página inicial personalizada quando um plugin ou um componente de tema a introduzir. Como eu planejava atualizar as preferências do usuário para redefinir a configuração da página inicial para o padrão -1.
Então, seguindo essa linha, essa nova configuração também atualizará as opções na configuração da página inicial nas preferências do usuário?
Por fim, se a página inicial padrão estiver definida como primeiro item no menu superior, e houver um link personalizado adicionado por meio de api.addNavigationBarItem() e colocado como o primeiro item, ele será realmente tratado como o primeiro item?