Não, isso ainda é o mesmo. O modificador de tema para páginas iniciais personalizadas substitui completamente a configuração do site. Navegar por isso é um pouco complicado porque, se um site tiver vários temas disponíveis e um deles não tiver uma página inicial personalizada, teríamos que gerenciar a opção de retorno (fallback). Algo para nós considerarmos.
Ainda não… as opções ainda são as mesmas do menu superior, de qualquer forma, mas uma coisa que mudou é que default (padrão) estará sempre disponível nas preferências do usuário agora (anteriormente era condicional). “Padrão” nas preferências do usuário seguirá a configuração do site.
Também é um “ainda não” aqui — fora de uma página inicial personalizada em um tema, a página inicial de um site Discourse ainda tem vários requisitos sobre ser uma página de lista de tópicos (ou /categories) e api.addNavigationBarItem() tem requisitos muito mais flexíveis.