Sim, usando parâmetros de consulta:
Restrinja os campos personalizados do usuário para pesquisar modificando o último parâmetro user_field_ids=1|2.
Por exemplo, user_field_ids=5 para pesquisar apenas no campo personalizado ID 5.
Há também alguns outros parâmetros disponíveis que você pode encontrar na documentação da API (documentos que não mencionam os campos do usuário, mas você pode facilmente fazer engenharia reversa da API.
Os campos personalizados devem ter a opção pesquisável marcada para que a consulta funcione:
Além disso, observe que a consulta não pesquisará apenas em campos personalizados, mas também em nomes de usuário e talvez nomes completos. Acho que não há um recurso integrado para filtrar apenas por campos personalizados.