別のドメインが動作せず、インストールが完了しました

ガイドに記載がないため、トンネルのみで良いと思います。

ホームネットワーク上にサーバーがある場合、トラフィックをルーティングする必要があるという考えに慣れているだけです。おそらく、Cloudflareの設定とポートの選択が、何らかの方法で自動的にそれを解決してくれるのでしょう。(この点について、どなたか意見があればぜひ!)