Pelo que me lembro, desde que o ajudei em muitos de seus trabalhos relacionados ao Discourse, lembro-me de ele ter usado um script Rails pós-importação. Ele selecionou os tópicos por palavras-chave em seus títulos, depois usou comandos oficialmente documentados para movê-los, como Administrative Bulk Operations.
Também me lembro que mover tópicos com tags, comandos oficiais e tarefas rake não atualizou completamente algumas tabelas, nem o trabalho relacionado do Sidekiq.
Não sei se ainda é o caso, mas isso pode ser algo a se prestar atenção em Bulk tagged topics, then moved topics into another category, but the category tag selector doesn't show tags - #3 by Canapin.
Espero que ajude!