Consigo reproduzir o problema no OP também. 
Não acho que o estilo antigo da página de tema/componente de tema deva ser acessível por nenhum link da interface do usuário? Acho que todos devem apontar para a nova versão atualizada de ‘configuração’.
Acho que os links nos avisos de administrador também levam ao estilo antigo.
Algumas capturas de tela para comparação:
Novo:
Antigo:
ETA:
Ah, posso ter entendido mal o que você quis dizer quando disse que os links estavam corretos. Não tenho certeza. 
Se for o caso, a única informação útil neste post pode ser que isso também acontece para os avisos de administrador no painel.
Linkando outro post que relata isso Introducing a new visual layout for themes and theme components - #19 by Moin