/var/www/discourse/public は十分な空き容量があるデータディスクにありましたが、アップデートを失敗した（他に文句を言っている人がいないので、おそらく私だけだと思います）ようで、/var/www/discourse/public/backups には古い/OSディスクへのシンボリックリンクがあり、そこには 7GB しか空きがありませんでした。
原因を突き止めるのに時間がかかりましたが、これが他の誰かの役に立ち、より早く解決できることを願っています。
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