バックアップが何度もS3へのアップロードに失敗しますが、最終的には成功します

メモリ不足の可能性はありますか?その例外は、Sidekiq(自動バックアップを実行しているプログラム)がOSによって停止されるか、何らかの理由でクラッシュしていることを示しているようです。

Dockerコンテナを再構築してみましたか?(./launcher rebuild app)それで解決するかもしれません。