Se os tópicos não estiverem listados, não importará que a categoria seja visível.
Parece que o que você quer é algum meio de incorporar comentários do Discourse em outro site via Javascript, mas ter esses tópicos não listados por padrão.
Pode ser possível que o plugin de automação faça isso ou talvez um pequeno plugin desliste automaticamente os tópicos criados em uma determinada categoria.
Tê-lo silenciado por padrão também pode ser tudo o que você precisa.