Sim, você pode dizer que com o App.yml você pode criar cópias de backup e nomeá-las de acordo com suas necessidades.
Se você estiver alterando uma seção específica, também poderá adicionar comentários. Eu, como auto-hospedado, tenho meus plugins organizados por oficial, pavilion e outros. Adiciono um comentário ao instalar um novo plugin na seção apropriada.
Outros, no entanto, podem ter ideias melhores do que as minhas.