ユーザーがメールが送信されたアドレスとは異なるアドレスから返信した場合、これは想定内の動作です。
もしこれらのメールへの返信を別のメールアドレスから許可すれば、他のユーザーになりすましてアカウントを悪用されるリスクが生じます。Meta のサポートメッセージでも、この問題に時折直面しています。
連絡用メールフォームが使用されている場合、通常はメールから送信され、Reply-To ヘッダーが設定されます。つまり、前述の同じ問題に直面することになります。
私個人としては、ここで素晴らしい解決策が見当たりません。チームの誰かに良いアイデアがあるかもしれません。