Eu acho que você não deveria desenvolver Rails ou Ember em uma instalação padrão, mas eu regularmente faço importações em um contêiner de produção. Como é apenas uma tarefa do Rake, você nem precisa reiniciar o servidor para que as alterações entrem em vigor.
Como não é público, deve ser seguro reverter para um backup se algo der errado. Provavelmente é aí que eu faria isso.
Você poderia fazer backup do site ativo e restaurá-lo no site de desenvolvimento, fazer o trabalho e depois fazer backup/restaurar de volta para o site ativo.