Meine Vermutung ist, dass Sie mehrere Engines (Discourse-Installationen) auf derselben Datenbank ausführen können (daher benötigen Sie eine separate Datenbank). Ich würde jedoch nur 1 Sidekiq ausführen. Andernfalls würden sich zwei davon um die Jobs streiten. Ansonsten denke ich, dass Discourse eine zustandslose App ist, daher sollte es keine Rolle spielen, wie viele Sie ausführen.
Nun eine Frage zum Kern des Problems: Warum? Und verstößt es nicht gegen SEO-Regeln? Ich glaube, Google mochte es nicht, wenn es denselben Inhalt auf mehreren Websites fand.