Minha suposição é que você pode executar vários motores (instalações do Discourse) sobre o mesmo banco de dados (então você precisa de um banco de dados separado). Eu executaria apenas 1 sidekiq, embora. Caso contrário, dois deles começariam a brigar pelos trabalhos. Fora isso, acho que o Discourse é um aplicativo sem estado, então não deveria importar quantos deles você está executando.
Agora uma pergunta para a raiz de todo o problema: Por quê? E isso não é contra as regras de SEO? Acho que o Google não gostou se encontrou o mesmo conteúdo em vários sites.