Você pode substituir o esquema de cores com CSS (mais detalhes aqui: Update themes and plugins to support automatic dark mode). Caso contrário, você precisaria criar um plugin personalizado para permitir que um administrador defina um tema diferente, já que isso não é uma funcionalidade existente no Discourse.
A ideia seria colocar o CSS do administrador no seu tema padrão; a menos que alguém vasculhasse seu CSS, você seria o único a ver/utilizá-lo.
Outra opção completamente diferente é usar um plugin de navegador como o stylish para definir CSS personalizado localmente.