Os endereços de e-mail estão na tabela user_emails. Você pode encontrá-los usando o ID do usuário:
UserEmail.where(user_id: <user_id>)
Substitua <user_id> no comando acima pelo ID do usuário.
Encontre o valor id do registro UserEmail que deseja remover. Com esse ID, execute o seguinte para retornar o registro individual que deseja excluir:
identical_email = UserEmail.find(<identical_email_id>)
Verifique novamente o resultado retornado para confirmar que é o e-mail que deseja remover. Em seguida, execute:
identical_email.destroy
Antes de executar qualquer comando destrutivo no console, é uma boa ideia criar um backup do banco de dados do seu site. Se algo der errado, você poderá restaurar o backup.