O Discourse é um Single Page Application e toda a marcação da página é criada no lado do cliente por meio do nosso aplicativo EmberJS.
Usar manipulação direta do DOM, como document.write, entra em conflito direto com toda a estrutura e tem uma chance muito baixa de “funcionar apenas assim”.
Recomendo tentar adaptar seu sistema de anúncios para usar nosso sistema de House Ads no Plugin Oficial de Anúncios. Talvez você possa ter um único anúncio no inventário de House Ads e usar o gatilho de mudança de página para contatar o servidor de anúncios e substituir o anúncio pela resposta? Ou talvez seu sistema de anúncios possa escrever diretamente no inventário de House Ads via API?