Você seguiu estas instruções? (Parece que não?)
É uma aposta bem segura, mas certifique-se de que você tem as coisas como no tópico de instalação multisite.
Se seus sites estão funcionando agora, então eu também encorajaria você a fazer uma instalação multisite limpa e fazer backup/restaurar os bancos de dados. Você pode copiar todo o resto como descrito em Mover um site Discourse para outro VPS com rsync