Linode内でのアップデート作業中に、データベースファイルがサーバーと互換性がない問題が発生

scp/rsyncでバックアップをコピーできます。そちらの方が簡単で高速です(もちろん、それが何を意味するかわからない場合は別ですが)。

新しいVMと新しいOS(古いOSのサーバーのバックアップではなく)を作成し、Move a Discourse site to another VPS with rsyncで説明されているように移動することを強くお勧めします。私がちょうどコピーした方も、所有権の問題がありました。あなたも同様の問題を抱える可能性が高いです。

discbakが他のサーバーと同じイメージで実行されている場合、証明書エラーが発生するはずです(http://にアクセスしない限り)。その後、HOSTNAMEにあるものにリダイレクトされるはずです。