こんにちは @Alienazk さん 
返信が遅くなり申し訳ありません。テストサイトで再現を試したところ、私の方では問題なく動作しているようです。まだ問題は解決していませんか？
私の手順：
- 新しいカテゴリを作成し、サブカテゴリとして設定する
- サブカテゴリ内にトピックを作成する
- サブカテゴリを
default categories mutedに設定し、履歴を適用する
- 新しいプライベートウィンドウでサイトを開き、匿名で確認する
- サブカテゴリ内のトピックが「最新」に表示されない
- テストユーザーとしてログインする
- サブカテゴリ内のトピックが「最新」に表示されない
- トピックを作成した管理者として、トピックの通知レベルを「通常」に設定する
- サブカテゴリ内のトピックが「最新」に表示されなくなる