この問題に直面しており、このスレッドを読んでもまだ非常に混乱しています。
コンパイル済みアセットではなく、S3 アップロードを CDN（CloudFront）から配信しようとしています。
設定画面で「s3 cdn url」を設定すると、期待通りに動作します（ただし、System upload not using s3 cdn url の問題は除きます）。
しかし、DISCOURSE_S3_CDN_URL を設定して再ビルドすると、フロントエンドが壊れてしまいます。これは、コンパイル済みアセットを S3 CDN URL から読み込もうとしているためです。
どうやら DISCOURSE_S3_CDN_URL / s3_cdn_url はアップロードにのみ影響し、DISCOURSE_CDN_URL はアセットにのみ影響するべきようです。