EMBER_CLI_PROD_ASSETS を 1 にするとアセットのプリコンパイルがクラッシュする

はい、その通りです。EmberJSプロジェクトが推奨するものに追従し、より標準的なものにするために、この新しいアセットパイプラインを数年かけて徐々にリリースしてきました。すでにロールアウトの最終段階に入っています。