Infelizmente, em uma instalação limpa do 3.0.0.beta16, não há tal trigger no psql que eu pudesse remover.
No entanto, restaurar o backup que fiz de um 2.9.0.beta12 falha com o mesmo erro.
ERRO: não é possível remover a coluna post_id da tabela bookmarks porque outros objetos dependem dela
DETALHE: o trigger bookmarks_polymorphic_data_sync na tabela bookmarks depende da coluna post_id da tabela bookmarks
EDIT:
Entendi agora - removi o trigger na origem - atualizar e restaurar backups começou a funcionar novamente - obrigado pela dica