まずは基本から見ていくべきだと思います。
- これは標準的なインストールですか？
- プラグインやカスタムテーマはインストールされていますか？
- 再構築した際に、出力にどのようなエラーが表示されますか（つまり、最後に「詳細なエラーについては上にスクロールしてください」と表示される場合、どのようなエラーが表示されますか？コードブロックにすべてコピーしてここに貼り付けていただければ確認できます）
- discourse-doctor はどのような変更を加えましたか/提案しましたか？また、インスタンスを「再起動」してそれらの変更が機能しなくなったのはどのような操作ですか？