Der Grund, warum Ihr Forum nach Discourse-Doctor wieder online geht, ist, dass die bestehende Version der Website vor dem Wiederaufbau neu gestartet wird. Sie sind also online, aber leider auch wieder am Anfang.
Wenn Sie ein aktuelles Backup haben, ist es vielleicht schneller, einen neuen Droplet mit einer frischen Instanz zu starten und Ihre Website dort wiederherzustellen?
Ich habe die Website nach ähnlichen Fehlern durchsucht, da ich befürchte, dass es sich nicht um einen handelt, mit dem ich persönliche Erfahrungen habe, aber ich habe die Antworten nicht gut genug verstanden, um sie beraten zu können. 
@pfaffman ist normalerweise gut darin. Würde so etwas funktionieren, oder ist das ein kompletter Fehlalarm?