Essa parece ser a maneira mais provável de o backup ter sido corrompido (dado que foi carregado e não está no mesmo local onde foi criado). Parece que alguns navegadores e/ou sistemas operacionais descompactam as coisas “prestativamente” imediatamente ao baixar, ou de outra forma dificultam saber que foi alterado.
Acho que o Windows torna excepcionalmente difícil saber se isso aconteceu, pois oculta explicitamente as extensões por padrão.
Se você estiver usando um sistema operacional onde é provável que alguém use esses comandos, provavelmente é improvável que isso tenha causado o problema. 