ファイル 'containers/app.yml' は書き込み不可です

[fzngagan (Faizaan Gagan)]

はい、root としてログインしていません。また、そのファイルは root ユーザーに属しています。そのため、そのファイルに書き込むことができないのです。

実際、EC2 では root に直接ログインすることはできません。現在は ubuntu ユーザーとしてログインしています。

sudo su - と入力してください。