Olá @Diyorki,
Com certeza, o tema padrão é melhor. Pense no tema padrão como um esqueleto. Você pode personalizá-lo. Então, esses temas, na maioria das vezes, apenas adicionam uma “pele” ao tema padrão. Se você quer que seu site pareça diferente ou tenha outras funções também, você precisa de um #tema ou #componente-de-tema. Esses temas, na maioria das vezes, não alteram nenhuma funcionalidade principal que possa causar danos ao SEO. No entanto, é possível causar esse tipo de problema com simples estilização CSS também, mas se você notar esse tipo de problema, podemos corrigi-lo. 
Quando você ativa um tema e algo dá errado com ele, você sempre pode voltar para o tema padrão. Você pode usar temas como um tema opcional separado ao lado do tema padrão. Assim, os usuários podem escolher entre diferentes temas, mas o tema padrão do site ainda será o padrão (claro).