Acho que o link de verificação está sendo gerado pelo plugin Booster for WC. Se for esse o caso, então não é algo que eu tenha testado. O problema que o plugin wp-discourse-woocommerce-support visa resolver é substituir um redirecionamento de login definido pelo WooCommerce em toda tentativa de login. Não testei com o WooCommerce recentemente, mas, no passado, quando o WooCommerce estava instalado em um site, ele impedia que usuários não logados fossem redirecionados para o Discourse ao tentar fazer login pelo WordPress.
O comportamento esperado é que, quando um usuário que não está logado no WordPress clicar no botão de login no Discourse ou em um link de login SSO gerado abaixo de uma publicação publicada no Discourse, o usuário será levado ao processo de login do WordPress e, em seguida, redirecionado para a URL correta do Discourse. Avise-me se isso não estiver funcionando corretamente para usuários que verificaram seu endereço de e-mail.
Pode ser possível fazer isso funcionar com o link de verificação que seus usuários estão clicando, mas acho que se trata de um problema separado.