OP（940eb28e…fc61a7c0）からの比較を使用すると、同じ結果が表示されます。2番目のコミットハッシュ（940eb28e…fc61a7c0d）の文字を1つ追加すると、正しい比較が得られます。
これはコミットハッシュの曖昧さ、つまりfc61a7c0で始まるコミットが2つあるため、どちらを使用すればよいかわからないことが原因であると疑っています。コミット履歴には見当たりませんが、孤立している可能性があります。
docker_manager は、そのURLのハッシュを取得するために git rev-parse --short を使用しているようです。理論的には、7文字（デフォルト）から始まり、一意性を保証するために必要に応じて長さを増やすハッシュが生成されます。ただし、孤立したコミットはプル時に無視されるため、DiscourseインスタンスでGitが一意であると信じているものが、GitHubでは一意ではない可能性があります。
ただし、これは非常にまれであり、投稿以降にコミットが行われているため、再度アップデートを確認すると問題はすでに解消されている可能性が高いです。