Não tenho certeza se isso faz diferença de qualquer forma. O problema fundamental é que, se você fizer um fork do Discourse, não poderemos oferecer nenhum tipo de suporte.
As únicas formas suportadas de extensibilidade são plugins, temas e o uso dos hooks no container.yml. Não há limite para o que eles permitem que você realize; fazer um fork realmente não faz sentido algum.