2つの現象が起きています…
@Canapin が指摘している通り、初期アニメーションは 5 秒後に 80% で終了します。そのため、接続が遅い場合、その状態で停止し、次のページに移動するまで完了しません。
@P16 のケースは、より高速な接続環境で私が経験する現象です。現在のページからの遷移が発生すると、アニメーションはたまたま進行していた位置で一時的に停止します。そして 1 秒ほど経ってから新しいページで再開されます（ここではバーの高さを誇張して表示しています）。
動きを継続させることが理想であるには同意しますが、実装方法を根本から変えない限り実現できないかもしれません…
フェードインではあまり効果がないと思います… コンテンツが存在するまでフェードインできないため、その分だけ表示が遅れてしまいます。速度の錯覚を生む可能性はありますが、技術的にはフェードインアニメーションの長さ分だけ遅くなります！
ふと気づいたのですが、目次コンポーネント（投稿をフェードインするため）でフェードインを（ある程度）テストできます。例えばこちらをご覧ください: https://meta.discourse.org/t/postgresql-13-update/172563。特に速いとは感じませんが、確かに「滑らか」です。