Bem-vindo, Mark! 
Reconstruir o aplicativo re-baixa o Discourse e sobrescreverá qualquer alteração que você fez dentro do contêiner.
Se você quiser trazer modificações para o Discourse, editar esses arquivos dessa maneira não é a maneira correta de fazê-lo.
Personalizar recursos do Discourse geralmente é feito com um componente de tema:
Ou um plugin:
Se você tem algum conhecimento de codificação, sugiro que dê uma olhada nesses links. 
Este link pode ser particularmente interessante:
À primeira vista, parece fazer exatamente o que você está procurando. Ele apenas visa outro arquivo na mesma pasta pai.