こんにちは。私も同じエラーが発生しました。
app/assets/javascripts に移動し、d/boot_dev --init を実行する前に yarn を実行することで修正できました。
私の仮説では、d/boot_dev --init は実行中に node_modules がどこかに存在することを前提としています。リポジトリをクローンしただけでは存在しないため、これは失敗します。
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