Let's encrypt、速度制限の解決策は何ですか？

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Let’s Encrypt のレート制限に達した場合、最も簡単な解決策は別のサブドメインを使用することです。ベアドメインにインストールした場合は、まず www を使用してください。どちらにしても推奨される方法です。

discourse-setup を実行していますか？これは、証明書が発行できない場合に証明書を要求しないようにするためのテストを実行します。