Por acaso recebo e-mails que contêm tabelas, e a primeira tabela e tudo o que vem depois dela não sobrevivem à conversão para Markdown. Isso faz com que as mensagens sejam interrompidas abruptamente, o que é muito confuso para os usuários. Eles podem ler o e-mail HTML original clicando no pequeno envelope, mas isso dificilmente é amigável para o usuário e provavelmente deve ser considerado um bug.
Editar a mensagem e colar a tabela HTML bruta nela parece funcionar bem. Por que não fazer isso durante a conversão para Markdown?