自分で修正されたようですね！それは良い知らせです。
これから読む方へ：v2.6.0.beta1 の直後に導入されたバグがありました。これを FIX: Backups should use relative paths for local uploads · discourse/discourse@f51ccea · GitHub で修正し、ベータブランチにもバックポートしました。
これ以降はバックアップが正しく作成されるようになり、v2.6.0.beta1 からバグ修正までの間に作成されたバックアップの復元も正常に動作するようになります。