您的意思是，您之前有支持线程的规则，但在最近一次更新后，线程功能不再生效？还是说，您期望在更新后该功能开始支持线程，但实际上并未实现？
我当前运行的是 discourse 093ee1d80c 和 discourse-chat-integration da91061（当前最新版本）。对于设置了 thread 规则的信道，其回复确实正确地以线程形式组织；但仅适用于配置了 thread 规则的信道。
能否展示您为线程规则所配置的示例？在“管理 → 插件 → 聊天集成”中，您应该能看到类似如下所示的规则：
点击编辑铅笔图标后，您应该看到：
如果您的规则显示为：
那么这些规则将不会使用线程功能。
上述说明也解释了为何该配置是按规则而非按站点进行设置的。
当您通过 Slack 中的 /discourse 命令（或您在设置集成时选择的任何命令）来创建规则时，请使用 thread 而非 watch 或 follow，具体可参考文档：Discourse Chat Integration