@R_X さん
もし propellerads が iframe タグを提供してくれれば、Discourse 広告プラグインで「ハウス広告」として実行するか、直接テーマ（またはテーマコンポーネント）内で実行できます。
重要なのは iframe タグを取得することです。Ember アプリケーションでは、スクリプトタグよりも iframe タグの方がはるかに実行しやすいためです。
参考までに、
@R_X さんのために早速検索してみたところ、状況が変わっていない限り、PropellerAds は iframe タグを提供しないようです。
例として以下をご覧ください:
もしこれが事実であれば、サードパーティのスクリプトタグを Ember と連携させるのはかなり複雑になるため、Discourse プラグインの開発者にご協力いただく必要があるでしょう。