報告ありがとうございます @James_Wong 
いいねとリアクションの集計と同期方法をバッチ処理ベースに作り直したので、実際には少し時間がかかるようになりましたが、主要なテーブルをブロックすることはなくなりました。
FIX: Recalculate like counters with one shared rule by ZogStriP · Pull Request #44647 · discourse/discourse · GitHub
FIX: Stop the reactions like sync from re-trashing likes every hour by ZogStriP · Pull Request #44648 · discourse/discourse · GitHub