つまり、コードを独自のプラグインに移す必要があります。直接コードを修正できるのであれば、そのスキルはお持ちだと信じています。他の人と同じようにインストールしてください。さもなければ、あなたの状況はサポート対象外です。除非誰かが余暇をたっぷり持っていて、あなたの独自ケースを解決する時間がある場合を除きます。
コアロジックが要件に合わない場合は、プラグインアーキテクチャを使用してください。そうすれば、少なくとも基本的なインストールは同じになります。将来的に更新がワンクリックで済むようになり、自分自身を助けることになります。また、後任の人も助かり、ここではより迅速なサポートが受けられるようになります。
必要なガイドはこちらです Developing Discourse Plugins - Part 1 - Create a basic plugin
ただし、そこまで進む前に、なぜネイティブの SSO サポートが要件に適さないのかを説明していただけると幸いです。その機能に関する SME がコメントしてくれるかもしれません。