VM内でこれだけが実行されていますか？
cat /proc/meminfo | grep MemFree の結果はどうなりますか？
Standard Installに従い、discourse-setupを実行しましたか？最小要件を満たしている場合、VMの仕様に合わせてメモリ設定が調整されるはずです。
app.yml の db_shared_buffers、unicorn_workers、db_work_mem は何ですか？
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