Sugeri que as alterações de configuração que ocorrem durante uma atualização sejam registradas nos registros de ações da equipe aqui: Log setting changes that happen because of an update in staff action logs
Isso não notifica você diretamente, mas pelo menos ajuda a descobrir por que uma configuração foi alterada. E também auxilia na configuração de uma automação que notifica você sobre essas alterações: Notify admin when site settings are updated by system - #11 by Moin