저도 그 기능을 사용할 때 문제를 겪었습니다. 읽기 전용 모드를 활성화하고 비활성화할 때 모두 마찬가지였죠. 마지막에는 결국 rails에서 Discourse.enable_readonly_mode를 실행해야 했습니다.
매번 이런 일이 발생하면 긴급 상황이 되어서 문제의 원인을 조사해 본 적이 없습니다.
참고로, 제 Ansible 도구에서는 읽기 전용 모드를 사용하지 않고 Introducing Post Deployment Migration 에 소개된 방식을 사용하고 있습니다.