Se você tiver espaço em disco e um docker atualizado, provavelmente ficará bem.
Se você tiver um sistema operacional desatualizado e isso o fizer ter um docker antigo, você deve iniciar uma nova VM e migrar para ela, conforme descrito em Mover um site Discourse para outro VPS com rsync.
Tenho certeza de que pelo menos a maioria das pessoas que tiveram problemas têm versões desatualizadas do Docker, a maioria das quais são causadas por versões desatualizadas do sistema operacional.
Se você iniciar uma nova VM, nada poderá dar errado, pois seu servidor antigo ainda estará disponível.