www.domain.com の SSL は無効です

Set up Let’s Encrypt with multiple domains / redirects の指示に従っていますか?

OP のテンプレートに www.mysite.com を入力すると、次のようなものが生成されます。

after_ssl:
   # tell letsencrypt what additional certs to get
    - replace:
        filename: "/etc/runit/1.d/letsencrypt"
        from: /--keylength/
        to: "-d www.mysite.com --keylength"
    - replace:
        filename: "/etc/runit/1.d/letsencrypt"
        from: /--fullchainpath/
        to: "-d www.mysite.com  --fullchainpath"
        global: true

したがって、あなたは間違っています。